关于土壤细菌基因组DNA做PCR的问题!各位能帮上忙的大侠们好,我用酚仿法从土壤中提取出基因组DNA用于做PCR,但就是没有产物,但是另外从大肠杆菌中提取的DNA扩增没有任何问题,效果非常好.所
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/05 13:01:20
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关于土壤细菌基因组DNA做PCR的问题!各位能帮上忙的大侠们好,我用酚仿法从土壤中提取出基因组DNA用于做PCR,但就是没有产物,但是另外从大肠杆菌中提取的DNA扩增没有任何问题,效果非常好.所
关于土壤细菌基因组DNA做PCR的问题!
各位能帮上忙的大侠们好,我用酚仿法从土壤中提取出基因组DNA用于做PCR,但就是没有产物,但是另外从大肠杆菌中提取的DNA扩增没有任何问题,效果非常好.所以可以说明是模板出了问题,可是模板到底出了什么问题,还请教大侠们告知一二,附图是我通过胶回收得来的土壤细菌的模板DNA,23000的marker!
感激!
关于土壤细菌基因组DNA做PCR的问题!各位能帮上忙的大侠们好,我用酚仿法从土壤中提取出基因组DNA用于做PCR,但就是没有产物,但是另外从大肠杆菌中提取的DNA扩增没有任何问题,效果非常好.所
Mmmmmm,这个问题啊,从你的描述确实是模板的问题了,导致PCR失败的模板问题无非两种:浓度和纯度,LS的兄弟说的不错,模板浓度太大不行,稀释做个梯度看看也许管用;另一方面,纯度的控制就没这么简单了,从土壤中提取的基因组中包括肯定不止一种微生物的DNA,对任何一种微生物DNA来说,其他微生物的DNA都算是杂质而且无法去除,同时氛氯仿法提取的DNA通常纯度不会太高,尤其你的介质又是土壤,难免有其他杂质除不干净,建议你用试剂盒纯化一下你的模板,我常用的纯化基因组的试剂盒是OMEga的PCR产物纯化试剂盒,其实对模板进行稀释,也就是对杂质进行稀释,以期达到一种平衡,使得模板能够作用而杂质不起作用,另:我不是做广告的
做pcr模板量不宜过大,你可以尝试做几个不同的组别对照,加不同的模板量,其他条件不变,来看看加多少量合适。看你的电泳图,总dna的量应该是很大的,所以20ul里加0.5甚至更少量的模板应该就够了。
1。土壤杂质多,酶抑制剂自然多,我们以前做粪便,都用玻璃乳吸附法纯化DNA的。你最好改变模板提取方法,比如玻璃乳吸附DNA。
2。大肠杆菌能做出来PCR结果,你能肯定土壤中保证存在同样的大肠杆菌模板么?如果模板不同 你必须改变相应的引物。(仅提个醒)。你从土壤中提取的DNA模板究竟是什么物种的模板?改变引物试试看哈。...
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1。土壤杂质多,酶抑制剂自然多,我们以前做粪便,都用玻璃乳吸附法纯化DNA的。你最好改变模板提取方法,比如玻璃乳吸附DNA。
2。大肠杆菌能做出来PCR结果,你能肯定土壤中保证存在同样的大肠杆菌模板么?如果模板不同 你必须改变相应的引物。(仅提个醒)。你从土壤中提取的DNA模板究竟是什么物种的模板?改变引物试试看哈。
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