Illumina_HiSeq_2000高通量测序结果分析你好,最近在看TCGA数据库,其中raw_count,scaled_estimate,normalized_count,没能看明白什么意思,分别代表什么,我想做转录水平基因表达差异分析,需要用到哪些数据.
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/06 18:32:24
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Illumina_HiSeq_2000高通量测序结果分析
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Illumina_HiSeq_2000高通量测序结果分析你好,最近在看TCGA数据库,其中raw_count,scaled_estimate,normalized_count,没能看明白什么意思,分别代表什么,我想做转录水平基因表达差异分析,需要用到哪些数据.
raw_count应该是某个转录本/基因的测到的原始reads条数,normalized_count是经过标准化的数据量;
差异分析需要统计 raw_count,FPKM值,pvalue
虽然我回答不了你的问题,但是我们公司肯定有人懂~