NCBI使用问题最近在做里氏木霉的纤维素酶(Trichoderma reesei cellulase)基因,遇到一个问题,做PCR需要引物,在NCBI上查酶基因序列时出来100多条,以前没用过NCBI,不知道应该用哪一个,请知道的生物学
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/02 03:34:25
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NCBI使用问题最近在做里氏木霉的纤维素酶(Trichoderma reesei cellulase)基因,遇到一个问题,做PCR需要引物,在NCBI上查酶基因序列时出来100多条,以前没用过NCBI,不知道应该用哪一个,请知道的生物学
NCBI使用问题
最近在做里氏木霉的纤维素酶(Trichoderma reesei cellulase)基因,遇到一个问题,做PCR需要引物,在NCBI上查酶基因序列时出来100多条,以前没用过NCBI,不知道应该用哪一个,请知道的生物学界达人教教我,
NCBI使用问题最近在做里氏木霉的纤维素酶(Trichoderma reesei cellulase)基因,遇到一个问题,做PCR需要引物,在NCBI上查酶基因序列时出来100多条,以前没用过NCBI,不知道应该用哪一个,请知道的生物学
里氏木霉的纤维素酶有很多种,其中内切酶就有很多种,比如糖苷酶12家族的酶切酶III:The X-ray crystal structure of the Trichoderma reesei family 12 endoglucanase 3.
还有若干种外切酶.
在NCBI上搜的时候Search选项选择PubMed,然后可以以Trichoderma reesei cellulase为关键词搜索,或者根据你要找的酶的种类和名字,比如是内切酶还是外切酶?被编为几号?这些都可以作为关键词来帮助你搜索.
然后找到你想要的酶的基因序列就可以了,不过设计引物的时候注意哪边是5'端.NCBI上给出的序列有些是基因的反补序列,需要用序列处理工具取反补,这样得到的才是基因序列.
出来很多的基因是不同物种的,每一个基因名字后面有个[ ],厘米标注的是该基因所属的物种,比如[Homo sapiens] 是之人类的基因。查出来候,你找到属于里氏木霉的就行了,sorry我不知道里氏木霉的英文
你要同时输入你需要的哪一个物种的纤维素酶基因,用那个物种的基因组做模板才能P出来这个基因啊~
NCBI上100多条并非是有100多种,NCBI是一个平台,很多做研究的人都把自己的结果放上去,同种不同株的话往往结果都不同,也就出现了你所说的一下出来100多条,其实试验内容是相同的,你可以自己分辨一下,取一个自己合用的就好了。